SARS-CoV-2 B.1.1.529（オミクロン）変異株が優勢となる前および期間中の、18歳以上の成人におけるSARS-CoV-2感染と入院状況（ワクチン接種状況別）— カリフォルニア州ロサンゼルス郡、2021年11月7日～2022年1月8日

2026年1月18日の大学入学共通テスト「生物基礎」で、新型コロナウイルスをテーマに免疫の仕組みを考えさせる出題がありました。

この設問の原著をDeepLを用いて和訳しました。機械翻訳ですので原文を参照してください。

原著

【和訳】
SARS-CoV-2 B.1.1.529（オミクロン）変異株が優勢となる前および期間中の、18歳以上の成人におけるSARS-CoV-2感染と入院状況（ワクチン接種状況別）— カリフォルニア州ロサンゼルス郡、2021年11月7日～2022年1月8日

2022年2月4日　（ブログ主の判断で文中の一部を太字にしました）

概要

このトピックについて既に知られていることは何ですか？
COVID-19ワクチンは、デルタ変異株によるものを含む、SARS-CoV-2関連重篤な結果に対して高い有効性を示しています。

本報告により追加される情報は何ですか？
2022年1月8日現在、オミクロン株が優勢であった期間において、ロサンゼルス郡における未接種者のCOVID-19発生率および入院率は、ブースター接種を完了した完全接種者と比較してそれぞれ3.6倍および23.0倍、ブースター接種なしの完全接種者と比較してそれぞれ2.0倍および5.3倍でした。デルタ株とオミクロン株の流行期を通じて、感染率と入院率は未接種者で最も高く、追加接種を受けたワクチン接種者で最も低くなりました。

公衆衛生実践における示唆は何でしょうか？
COVID-19ワクチン接種を最新の状態に保つことは、SARS-CoV-2感染および入院から身を守るために極めて重要です。

COVID-19ワクチンは、COVID-19の原因ウイルスであるSARS-CoV-2への感染予防、ならびに実環境下における重篤なCOVID-19関連転帰の予防に有効です（1,2）。SARS-CoV-2感染およびCOVID-19関連入院のリスクは、未接種者に比べて完全接種者において低くなっております。この減少は、追加接種またはブースター接種（ブースター）を受けた人々においてさらに顕著です（3,4）。B.1.1.529（オミクロン）変異株は、これまでのSARS-CoV-2変異株よりも急速に拡大していますが、最近の研究によれば、オミクロンによる疾患の重症度はB.1.617.2（デルタ）変異株と比較して低いことが示唆されています。しかしながら、感染者数の多さにより、これまでの感染拡大時よりも医療システムに負担がかかっています（5）。*,† ロサンゼルス郡公衆衛生局（LACDPH）は、COVID-19サーベイランスおよびカリフォルニア予防接種登録システム2（CAIR2）のデータを用いて、2021年11月7日から2022年1月8日までの期間における、COVID-19ワクチン接種状況および優勢変異株別に、年齢調整済み14日間累積発生率および入院率を分析しました。デルタ株が優勢であった最後の週である2021年12月11日終了時点の14日間において、未接種者の発生率および入院率は、ブースター接種済みの完全接種者と比較してそれぞれ12.3倍および83.0倍、ブースター未接種の完全接種者と比較してそれぞれ3.8倍および12.9倍でした。オミクロン株が優勢となった期間（2022年1月8日終了週）では、これらの比率が低下し、未接種者の感染率と入院率は、ブースター接種済みの完全接種者と比較してそれぞれ3.6倍および23.0倍、ブースター未接種の完全接種者と比較してそれぞれ2.0倍および5.3倍となりました。さらに、分析期間全体を通じて、集中治療室（ICU）への入院、人工呼吸器装着のための挿管、死亡は、ブースター接種の有無にかかわらず完全接種済みの方と比較して、未接種の方においてより高い確率で発生しました（p<0.001）。発生率および入院率は、一貫して未接種の方で最も高く、ブースター接種済みの完全接種済みの方で最も低くなりました。新型コロナウイルス感染症（COVID-19）ワクチン接種を最新の状態に保つことは、SARS-CoV-2感染および関連する入院から身を守る上で極めて重要です。
ロサンゼルス郡公衆衛生局（LACDPH）は、2021年11月7日から2022年1月8日までの期間に、検査でSARS-CoV-2感染が確認された（核酸増幅検査または抗原検査によるSARS-CoV-2陽性結果）18歳以上のロサンゼルス郡住民を対象に横断的分析を実施しました。§ 対象者は、BNT162b2（ファイザー-ビオンテック）、mRNA-1273（モデルナ）、またはAd.26.COV2.S（ヤンセン［ジョンソン・エンド・ジョンソン］）ワクチンの初回接種シリーズ最終回接種後14日以上経過した者を「完全接種済み」と定義しました。S（ヤンセン［ジョンソン・エンド・ジョンソン］）ワクチンの接種を完了したものとみなされ、mRNAワクチンまたはヤンセンワクチンの初回接種から14日未満の場合、またはCAIR2に一致する予防接種記録が確認できなかった場合は未接種とみなされました。¶ 追加接種を受けた完全接種者は、追加接種日から14日以上経過した時点で追加接種を完了したものとみなされました。** 部分接種者（2回接種シリーズの第1回接種から14日以上経過しているが、第2回接種を受けていない、または第2回接種から14日未満経過している者）における感染は、サンプルサイズが小さいため除外されました。†† COVID-19関連入院は、SARS-CoV-2の検査による陽性結果が初めて確認されてから14日以内に発生した入院と定義されました。（6）。LACにおける定期的なゲノム監視を実施している研究所からの全ゲノム配列決定データを用いて、週ごとの変異株割合を算出しました。§§ 入手可能な全ての変異株データは検体採取日別に報告され、デルタ株およびオミクロン株の優勢期間（配列決定検体の50％超を占める期間）の評価に用いられました。
SARS-CoV-2感染の人口統計学的・臨床的特徴は、ワクチン接種状況別に比較されました。カテゴリ変数にはピアソンのカイ二乗検定を、中央値にはクルスカル・ウォリス検定を適用しました。P値＜0.05を有意とみなしました。ロサンゼルス郡（LAC）在住の18歳以上を対象に、年齢調整済み14日間移動平均のSARS-CoV-2感染率および入院率、ならびにその率比を、2019年人口推計に基づきワクチン接種状況別に推定し、2000年米国標準人口を用いて標準化いたしました。¶¶ 解析にはSAS（バージョン9.4；SAS Institute）およびR（バージョン3.6.2；R Foundation）を使用いたしました。本活動はロサンゼルス郡公衆衛生局（LACDPH）の機関内審査委員会により、公衆衛生業務に必要な監視活動と判断され、審査委員会による審査は不要とされました。
2021年8月中旬から同年11月のオミクロン株出現まで、ロサンゼルス郡住民のSARS-CoV-2感染例（検体シークエンス解析実施例）のほぼ100％がデルタ株によるものでした。ロサンゼルス郡における既知の最も早期のオミクロン株感染は、2021年11月最終週に採取された検体で確認されました。オミクロン株の出現に伴い、デルタ株の有病率は12月11日終了週に95%減少しました。オミクロン株は12月18日終了週にロサンゼルス郡における主要なSARS-CoV-2変異株となり、全シーケンス検体の57%を占めました。オミクロン株の流行は継続的に拡大し、2022年1月8日終了週には全シーケンシング検体の99%を占めました（補足図、https://stacks.cdc.gov/view/cdc/113859）。

2021年11月7日から2022年1月8日までの期間に、中南米・カリブ海地域の18歳以上の住民で報告された422,966件のSARS-CoV-2感染例のうち、合計141,928件（33.6%）が未接種者、56,185件（13.3%）がワクチン接種者でした。2021年11月7日から2022年1月8日までの間に報告されたSARS-CoV-2感染者422,966例のうち、合計141,928例（33.6%）が未接種者、56,185例（13.3%）が追加接種済みの完全接種者、224,853例（53.2%）が追加接種なしの完全接種者でした（表）。未接種者は入院（2.8%）、集中治療室（ICU）への入院（0.5%）、機械的換気のための挿管（0.2%）が必要となる可能性が最も高く、 これらの結果は、追加接種を受けた完全接種者（それぞれ0.7％、0.08％、0.03％）および追加接種を受けていない完全接種者（それぞれ1.0％、0.12％、0.05％）ではより低頻度でした（p<0.001）。死亡についても、未接種者（0.3%）が、追加接種を受けた完全接種者（0.07%）や追加接種を受けていない完全接種者（0.08%）よりも発生率が高くなりました（p<0.001）。

デルタ株が優勢であった最終週（12月11日終了週）において、 年齢調整済み14日間累積発生率および入院率は、未接種者で最も高く（それぞれ10万人あたり443.9および45.9）、ブースター接種済みの完全接種者（それぞれ36.1および0.6）、ブースター未接種の完全接種者（それぞれ115.9および3.6）では低くなりました。オミクロン株が優勢となるにつれ、デルタ株優勢期と比較して、年齢調整済み発生率および入院率は、ワクチン接種状況にかかわらず、すべてのグループで上昇しました（図1）。2022年1月8日現在、年齢調整済み14日間累積発生率および入院率は、未接種者において依然として最も高く（それぞれ10万人あたり6,743.5および187.8）、 ブースター接種を受けた完全接種者（それぞれ1,889.0および8.2）、ブースター接種を受けていない完全接種者（それぞれ3,355.5および35.4）が最も低くなりました。

全体として、2021年11月7日から2022年1月8日までの期間において、未接種者の発生率および入院率が最も高くなりました。デルタ株が優勢であった最終週において、ブースター接種を完了した完全接種者と比較すると、未接種者の発生率および入院率はそれぞれ12.3倍および83.0倍高く（図2）、ブースター接種を受けていない完全接種者と比較すると、未接種者の発生率および入院率はそれぞれ3.8倍および12.9倍高くなっていました。2022年1月8日現在、オミクロン株が優勢となった期間においては、両比較ともこれらの率比は低下し、未接種者の感染率および入院率は、追加接種済みの完全接種者との比較ではそれぞれ3.6倍および23.0倍、追加接種なしの完全接種者との比較ではそれぞれ2.0倍および5.3倍となりました。

考察

2021年11月7日から2022年1月8日にかけて、LAC成人におけるSARS-CoV-2感染は急速に増加し、オミクロン株がデルタ株に取って代わり優勢株となった時期に最大の増加が見られました。これにより、未接種者の感染率および入院率比は、ブースター接種の有無にかかわらずワクチン接種済み者と比較して低下しました。オミクロン株が優勢であった週の発生率および入院率はデルタ株優勢時と比較して高かったものの、ワクチンによる重症化予防効果は持続しており、特に追加接種を受けた者において顕著でした（ただしオミクロン株に対する予防効果はデルタ株と比較して低下）。主要変異株にかかわらず、すべての罹患率および入院率の比は1を超えており、未接種者のリスクが一貫して最も高く、COVID-19ワクチンがSARS-CoV-2感染およびCOVID-19関連入院に対して、完全接種者において予防効果を示し、特に追加接種を受けた者において最も高い予防効果を発揮していることを示しています。
オミクロン株では疾患の重症度は低いように見えますが、オミクロン株が優勢となった期間における感染の急激な増加により、比較的多くの入院患者が発生しました（5）。感染急増時の大量入院は、医療従事者の不足や疲労蓄積の影響を悪化させ、医療部門に負担をかける可能性があります。ロサンゼルス郡（LAC）における入院率の上昇は、未接種者で最も顕著であり、一方で完全接種者では入院率が低く抑えられ、追加接種を受けた者では最も低い水準でした。COVID-19ワクチン接種を最新の状態に保つことは、医療施設への負担軽減において極めて重要な要素です。
本報告書の知見には、少なくとも5つの限界が伴います。第一に、検査で感染が確認された時点でLACに居住していたものの、カリフォルニア州外でワクチン接種を受けた方の接種データが入手できず、接種状況の誤分類が生じました。記録が確認できない接種済みの方が未接種とみなされた場合、未接種者の発生率が過小評価される可能性があります。追加接種（ブースター）が初回接種と誤分類された可能性があり、該当者は部分接種者と誤って分類され除外された可能性があります。第二に、年齢調整以外に、性別や人種・民族などワクチン接種率に関連する他の要因を調整することはできませんでした。これらの特性によるワクチン接種率および追加接種率の差異、特にSARS-CoV-2感染率との比率が異なる場合、本結果をラテンアメリカ・カリブ海地域（LAC）やその他の集団・管轄区域へ一般化する際に影響を及ぼす可能性があります。第三に、SARS-CoV-2感染リスクは全ての人において均等ではありません。曝露の可能性がCOVID-19ワクチン受容率および接種率に影響を与える可能性があります。感染や入院の可能性に関連する外部リスク要因、例えばサンプル特性や健康の社会的決定要因などは、これらの知見を解釈する際に考慮すべき重要な点です。第四に、COVID-19関連入院は、入院日とSARS-CoV-2検査日のみに基づいて判定されたため、COVID-19が原因でない入院患者における偶発的な陽性検査結果が含まれている可能性があります。最後に、ゲノム配列解析データはSARS-CoV-2検体の一部サンプルのみに利用可能であり、全ての感染を代表しているわけではありません。しかしながら、変異株の優勢傾向は、これらの期間中に全国的に報告されたものと一致していました。
これらの知見は、最近の研究結果と一致しており、COVID-19ワクチン接種がオミクロン株を含むSARS-CoV-2変異株による重症COVID-19から保護することを示しています（7,8）。*** COVID-19ワクチン接種および追加接種の促進は、COVID-19関連入院や重篤な転帰を予防する上で極めて重要です。ワクチン接種データやSARS-CoV-2変異株のゲノム配列データと連携した継続的なCOVID-19サーベイランスは、特にオミクロン株が優勢な期間において、ワクチンの有効性や追加接種による保護効果の増強を監視する上で不可欠です。

謝辞

Sydney Colitti、Bonnie Dao、Yajun Du、Prabhu Gounder、Carmon Greene、Jennifer Griffin、Israa Khanqadri、Rebecca Lee、Perkesa Page、Harry Persaud、Mirna Ponce Jewell、Patricia Reynolds、Debora Roman、Zachary Rubin、Heidi Sato、Andrei Stefanescu

参考記事
この設問の問題点について、下記のマルス氏の記事が参考になります。

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